Юнона почиталась как покровительница брака и охранительница нерушимости и святости брачных союзов. Считалось, что она посылает супругам многочисленное потомство и благословляет мать во время рождения детей.
Вместе со своим мужем Юпитером и богиней Минервой Юнона входила в капитолийскую троицу. Всем трем божествам был посвящен общий храм на Капитолии. Прозвища богини - Регина ("царица"), Фульгура ("молние-метательница"), Луцина ("светящаяся") - свидетельствуют о том, что она была женской ипостасью Юпитера и одним из верховных божеств римского пантеона.
Юнона отличалась ревнивым характером. Так, Овидий в "Метаморфозах" повествует о том, как Юпитер полюбил прекрасную Ио. Узнав об этом, Юнона разгневалась и превратила Ио в белую корову. Но этого ей показалось мало. Юнона послала страшного овода, который жалил корову-Ио. Прошло немало времени, пока Юпитеру не удалось вернуть человеческий облик несчастной Ио. В другой раз Юнона превратила в медведицу нимфу Каллисто, в которую также влюбился Юпитер. Однако Юпитер подарил Каллисто бессмертие, и она стала одним из прекраснейших небесных созвездий - Большой Медведицей.
Римляне верили, что каждую женщину всегда сопровождает свой добрый дух, также называемый юнона, как каждого мужчину сопровождает свой гений.
1 марта отмечался праздник Юноны - матроналии.В ритуалах, посвященных богине, могли участвовать только замужние женщины - матроны. В культе Юноны сохранились следы тотемизма: ее иногда изображали с головой лошади. Уже одно это указывает на то, что Юнона является одной из самых древних богинь Рима. Богиню также отождествили с греческой Герой.